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细菌是几乎无处不在的微小生物，生活在我们的身体内和体表。通常，我们将细菌与疾病联系起来。实际上，大多数细菌对我们的健康有益。人体内的细菌比人体细胞更多，每个部分都有不同类型的细菌。
肠道中有万亿细菌，科学家称之为直肠微生物群。人类与这些细菌保持着一种共生的关系。人类所摄入的食物能够为肠道菌群提供食物或能量，这些肠道菌群通过产生多种营养物质来影响机体健康，比如维生素，同时还能够明显影响机体免疫系统的健康，还有研究显示，肠道菌群能够影响大脑健康。来自英国诺丁汉大学和伦敦国王学院的研究人员对一个大型的中老年女性队列进行了肠道菌群检测，他们发现肠道菌群的多样性与许多健康状况都有相关性（相关研究结果发表在国际学术期刊Scientific Reports上）。
来自哈佛大学George Church实验室的博士后Scheiman认为"微生物会影响我们的能量代谢，从而导致我们更容易吸收碳水化合物、蛋白质以及纤维等。此外，它们还参与了炎症反应以及神经功能的实现。因此，微生物组或许与耐力、恢复力以及心理强度等存在内在的联系"。